Untuk memenuhi serta mendukung berbagai kegiatan, baik untuk kebutuhan belajar mengajar, kehidupan sehari-hari, kegiatan ekstra kurikuler, kenyamanan santri, guru, wali santri serta orang-orang yang tinggal di lingkungan pesantren, maka Pondok Pesantren Sunan Giri Al-Wahdah dilengkapi fasilitas sebagai berikut :

1) Fasilitas Ibadah

Musholla Putra sebagai sentral kegiatan para santri, ustadz, serta orang-orang yang tinggal di lingkungan pesantren. Musholla sebagai tempat ibadah utama dan digunakan untuk kegiatan pengajian majlis ta’lim masyarakat sekitar dan tempat pertemuan santri yang berkenaan dengan ibadah.

Musholla Putri Sebagai pusat kegiatan para santri dan ustadzah Ketika kegiatan program pesantren sedang berlangsung, dilengkapi dengan pendingin ruangan (AC),sound system, bersih dan nayaman untuk para santri.

2) Fasilitas Sekolah

Ruang kelas ; yang terdiri dari ruang kelas Putra sebanyak 3 unit dan ruang kelas Putri sebanyak 3 unit kelas yang semuanya di tata sedemikian rupa agar santri fokus Ketika pembelajan.

Perpustakaan; Ruang membaca bagi santri yang ingin menambah wawasan dalam pola pikir serta menambah ilmu-ilmu yang mungkin belum santri ketahui, dilengkapi dengan rak buku,meja kursi,dan pendingin ruangan (AC)

3) Fasilitas Asrama

Gedung asrama ; yang terdiri dari 6 unit gedung asrama Putra dan 3 unit gedung asrama Putri. Masing-masing gedung terdiri antara 3-4 kamar, setiap kamar hanya akan di tempati oleh 4 santri.

Kantin ; terletak tersebar di beberapa lokasi pesantren

Ruang makan ; masing-masing asrama terdapat ruang makan dan setiap santri wajib menjaga kebersihan dan ketertiban ruangan tersebut.

Kamar Mandi (MCK); Setiap asrama di lengkapi kamar mandi yang bersih untuk para santri.

4) Fasilitas Pendukung
Berbagai fasilitas pendukung antara lain ; Dapur Umum, koperasi, Kantor Pondok Pesantren, laundry, Tours & Travel, Sumber air yang lebih dari cukup, serta taman-taman yang tersebar di sekitar lingkungan Pesantren.